中国語南アフリカの新型コロナウイルス変異株501Y-V2
2020年12月18日、南アフリカで新型コロナウイルスの501Y-V2変異株が検出された。現在、南アフリカの変異株は20カ国以上に広がっている。実験により、上記の新型コロナウイルス変異体は、ワクチン誘発血漿中和抗体の中和能力を低下させる可能性がある、K417N/T、E484K、N501Y変異の他の新型コロナウイルス変異体を保有している可能性があることが示されています。しかしながら、参照ゲノムWuh01(配列番号MN908947)と比較して、南アフリカ変異体ゲノム配列の501Y.V2は23ヌクレオチド変異体を有する。これは英国変異株 B.1.1.7 サブタイプと同じ N501Y 変異を持っていますが、S タンパク質の 2 つの重要な部位 E484K および K417N に依然として変異が含まれており、ウイルスの感染能力に潜在的に重要な影響を及ぼします。
新型コロナウイルスは一本鎖RNAウイルスであり、ゲノム変異がより頻繁に起こります。単一ターゲットの検出では、ウイルス量が少ないサンプルや変異したウイルス株の検出ミスが起こりやすくなります。対象検出における単一陽性者の再検査率は10%を超える場合があり、作業負荷が増加し、診断時間が長くなる可能性があります。複数のターゲットを検出し、各ターゲットの結果を相互に検証することで、検出率が向上し、早期診断が容易になります。
図1. 新型コロナウイルスの感染メカニズムの模式図
英国の新型コロナウイルス変異株B.1.1.7
2020 年 12 月 26 日、B.1.1.7 株に関する最初の科学論文がオンラインで公開されました。英国ロンドン大学衛生大学および熱帯病研究所は、B.1.1.7 株が他の株よりも拡散する能力が 56% (95% CI 50 ～ 74%) 以上であることを確認しました。この新しい変異株はより明らかな感染力を持っているため、新型コロナウイルス感染症を制御することはさらに困難になっています。翌日、英国のバーミンガム大学が MedRxiv に記事をアップロードしました。この研究では、B.1.1.7変異株（S遺伝子ドロップアウト）に感染した患者のORF1abおよびNウイルス遺伝子のコピー数が大幅に増加していることが判明した。この現象は集団内で監視されました。この論文は、英国の変異株 B.1.1.7 に感染した患者のウイルス量が著しく高いため、この変異株の病原性も高い可能性があると指摘しています。
図 2. 英国のコロナウイルス変異株 B.1.1.7 に含まれるゲノム変異配列
図 3. N501Y 変異は英国と南アフリカの両方で発生バリエーション
新型コロナウイルス変異株検出キット
Chuangkun Biotech Inc.は、B.1.1.7および501Y-V2の新型コロナウイルス変異種の検出キットの開発に成功した。
この製品の利点: 高感度、4 つのターゲットを同時に検出、B.1.1.7 変異株と 501Y.V2 南アフリカ変異株の主要な変異部位をカバーします。このキットは、N501Y、HV69-70del、E484K 変異部位と新型コロナウイルス S 遺伝子を同時に検出できます。迅速な検査: サンプル採取から結果までわずか 1 時間 30 分しかかかりません。
図 4. 新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) 英国変異体の増幅曲線の検出
図 5. 新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) の南アフリカ変異型の検出 増幅曲線
図6. 新型コロナウイルスの野生型増幅曲線
これらの変異がパンデミックである新型コロナウイルス感染症の新たな長期的な影響をどのように蓄積するのかは明らかではない。しかし、このことは、これらの突然変異が自然免疫やワクチン接種によってもたらされる免疫の有効性に影響を与える可能性があることを思い出させます。また、このことは、新型コロナウイルスを長期間継続的に監視し、新型コロナウイルスの進化に対応するために新型コロナウイルスワクチンを更新する必要があることを思い出させます。
投稿時間: 2021 年 3 月 12 日